Pada suatu sore yang hujan, Detektif Boys menyaksikan pembunuhan di seberang jalan. Karena dilarang oleh lalu lintas, pelakunya pergi dan Conan Edogawa meninggalkan satu petunjuk oleh detektif yang sedang sekarat. Beberapa hari kemudian, seorang detektif lain ditemukan terbunuh di tempat parkir, meninggalkan polisi berguncang. Mencurigakan bahwa pelakunya adalah salah satu dari mereka sendiri, semua orang di departemen kepolisian tanpa alibi adalah tersangka. Namun meski waspada, mereka dikalahkan dan menderita serangan lagi — kali ini dengan Ran Mouri menemukan dirinya dalam baku tembak. Traumatized, Ran terbangun di rumah sakit dengan amnesia retrograde, mengingat apa-apa tentang hidupnya. Segera dibebaskan, dia berjuang untuk mengingat masa lalunya dan menjadi takut tidak mendapatkan kembali ingatannya sebelum menjadi sasaran pembunuh untuk apa yang dia saksikan. Karena dia dijaga oleh teman dan keluarga, terserah kepada Conan untuk mengumpulkan petunjuk dan menemukan siapa pembunuhnya sebelum mereka menyerang lagi.